تععین جایگاه تاکسونومیکی شاه بلوط ایران بر اساس نشانگرهای مولکولی

پایان نامه
چکیده

شاه بلوط یکی از سرده های ارزشمند جنگل هیرکانی از جمله جنگل های گیلان است که نخستین بار حضور آن توسط پارسا (1950) گزارش شد. متاسفانه از تاریخچه پراکنش این گونه و وسعت پراکنش آن اطلاعات چندانی موجود نیست، اما آنچه مشخص است اندک رویشگاه های به جا مانده از این گونه نیز به دلیلی تخریب وسیع انسانی و ابتلا به بیماری، از وضعیت مطلوبی برخوردار نیستند. اگرچه شاه بلوط های موجود در جنگل های شمال ایران تحت همان نام شاه بلوط اروپایی شناخته می شود، تاکنون مطالعه جامعی در جهت شناسایی این شاه بلوط ها صورت نپذیرفته است. در این تحقیق، تکنیک dna بارکدینگ به عنوان روشی آسان و سریع برای شناسایی جایگاه تاکسونومیکی شاه بلوط های شمال ایران مورد استفاده قرار گرفت. در این تحقیق، از تمامی رویشگاه های این گونه در ایران (سه رویشگاه ذکر شده در بخش غربی استان گیلان) نمونه برگ تهیه و بعد از بیومتری، شش پایه انتخاب و ناحیه ژنی psba ، فاصله انداز غیرکد کننده trnh-psba و trnl-f توالی یابی شد. نتایج نشان داد که طول کل قطعه ژنی psba برای نمونه های شاه بلوط گرفته شده از بانک ژنی و شاه بلوط های منطقه هیرکانی 66 جفت باز و بدون تنوع نوکلیوتیدی و طول قطعه بین ژنی trnh-psba،448 -436 جفت باز است که شاه بلوط های منطقه هیرکانی با حذف 12 جفت باز دارای کمترین طول به میزان 436 جفت باز است. از پنج جایگاه انحصاری در این ناحیه، جایگاه انحصاری اول و دوم در موقعیت 366 و 495 مربوط به گونه castanea dentata، جایگاه انحصاری سوم در موقعیت 401 و مربوط به c. sativa، جایگاه انحصاری چهارم و پنجم در موقعیت 406 و 437 مربوط به گونه c. pumila است. همچنین طول کل قطعه بین ژنی trnl-f، بین 378-389 جفت باز است که شاه بلوط موجود در ایران با حذف 11 جفت باز دارای کمترین طول به میزان 378 جفت باز است. بررسی فاصله ژنتیکی گونه ها و جمعیت های مورد بررسی نشان داد که نمونه های جنگل هیرکانی فاقد فاصله ژنتیکی از یکدیگر بودند. این ناحیه دارای شش جایگاه متغیر و از نوع انحصاری مربوط به نمونه های بانک ژنی بود. جایگاه انحصاری اول و دوم در موقعیت 24 برای , c. mollissima c. seguinii و 244 مربوط به گونه c. mollissima، ، جایگاه انحصاری سوم و چهارم در موقعیت 148 و 313 مربوط به گونه c. dentataو c. pumila (ay586304) و جایگاه انحصاری پنجم و ششم در موقعیت 365 و366 مربوط به گونه ی c. sativa است. در این تحقیق، براساس ناحیه ژنی psba و بین ژنی trnh-psba چهار هاپلوتیپ و بر اساس ناحیه ی بین ژنی trnl-f شش هاپلوتایپ شناسایی شد. در درخت فیلوژنی حاصل از تحلیل کل ناحیه ژنی psba و بین ژنی trnh-psba و trnl-f به روش حداکثر شباهت و با پشتوانه تکرار 1000، شاه بلوط های مورد مطالعه در یک کلاد با پشتوانه کمتر از 50 قرار گرفتند. همچنین بیشترین شباهت ژنتیکی بین شاه بلوط های موجود در جنگل های شمال ایران و شاه بلوط اروپایی مشاهده شد. اگرچه تصمیم گیری در مورد جایگاه تاکسونومی شاه بلوط های موجود در شمال ایران براساس یک یا دو نشانگر کلروپلاستی از پشتوانه قوی برخوردار نمی باشد، ولیکن به دلیل وجود تفاوت ریختی قابل ملاحظه بین این شاه بلوط ها و شاه بلوط اروپایی و نیز نتایج این تحقیق، تعلق شاه بلوط مورد مطالعه به گونه شاه بلوط اروپایی (c. sativa) را مورد تردید قرار می دهد و تصمیم گیری نهایی در این ارتباط را منوط به بکارگیری نشانگرهای بارکد هسته ای به همراه کلروپلاستی می نماید.

منابع مشابه

تنوع ژنتیکی برخی ژنوتیپ های بومی آلبالو در ایران بر اساس نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی

در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی نوزده ژنوتیب آلبالوی بومی کشور از استان‌های آذربایجان غربی، آذربایجان شرقی، کردستان، تهران، کهگیلویه و بویراحمد، اصفهان، کرمان، خراسان رضوی، البرز، فارس و رقم اردی بوترمو از مجارستان به عنوان شاهد، به کمک نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. در آزمایش اول سی و چهار صفت کیفی و یازده صفت کمی مورد مطالعه قرار گرفت. تجزیه واریانس تفاوت معنی‌داری در سطح احت...

متن کامل

جایگاه تاکسونومیکی و تنوع ژنتیکی جنس شاه بلوط (راشیان) در شمال ایران براساس ناحیه ژنی psba و بین ژنی trnh-psba

شاه بلوط اروپایی (castanea sativa mill.) یکی از گونه های ارزشمند در خطر جنگل­های هیرکانی است. در این تحقیق، استفاده از نشانگرهای مولکولی به عنوان روشی آسان و سریع برای شناسایی جایگاه تاکسونومیکی شاه بلوط­های شمال ایران مورد استفاده قرار گرفت. در این تحقیق، از تمامی رویشگاه­های این گونه در ایران (سه رویشگاه ذکر شده در بخش غربی استان گیلان) نمونه برگ تهیه و بعد از بیومتری، شش پایه انتخاب و ناحیه ...

متن کامل

تمایز ژنتیکی در جمعیت‌های مختلف بلوط ایرانی (Quercus brantii) بر اساس نشانگرهای بین‌ریزماهواره‌ای ژنومی

بلوط‌ها اصلی‌ترین گونه‌های درختی تشکیل‎دهنده جنگل‌های زاگرس‌ هستند. اطلاعات درباره الگوهای طبیعی تنوع ژنتیکی از اهمیت کاربردی بالایی برای مدیریت و حفاظت پایدار جنگل‌ها برخوردار است. در این مطالعه برای ارزیابی تمایز و تنوع ژنتیکی بین و درون هشت جمعیت بلوط ایرانی متشکل از 104 ژنوتیپ با شرایط رویشگاهی متفاوت از جنگل‌های ایلام، DNA ژنومی استخراج و قطعات تکثیریافته با آغازگرهای مختلف بر روی ژل 2/1 د...

متن کامل

تنوع ژنتیکی برخی ژنوتیپ های بومی آلبالو در ایران بر اساس نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی

در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی نوزده ژنوتیب آلبالوی بومی کشور از استان های آذربایجان غربی، آذربایجان شرقی، کردستان، تهران، کهگیلویه و بویراحمد، اصفهان، کرمان، خراسان رضوی، البرز، فارس و رقم اردی بوترمو از مجارستان به عنوان شاهد، به کمک نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. در آزمایش اول سی و چهار صفت کیفی و یازده صفت کمی مورد مطالعه قرار گرفت. تجزیه واریانس تفاوت معنی داری در سطح احت...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی برخی ژنوتیپ‌های مرکبات ایران بر اساس خصوصیات مورفولوژی و نشانگرهای مولکولی ISSR و PCR-RFLP

سابقه و هدف: ژرم‌پلاسم مرکبات ایران تنوع ژنتیکی گسترده‌ای دارد که ناشی از دگرگرده‌افشانی، سابقه طولانی ازدیاد بذری و فراوانی جهش‌های ژنتیکی است. برای تعیین وضعیت رده‌بندی، روابط فیلوژنتیک و فاصله ژنتیکی بین افراد این ذخیره ارزشمند ژنتیکی باید از ویژگی‌های مورفولوژی در کنار نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA استفاده کرد. در تحقیق حاضر برای کسب اطلاعاتی در مورد درجه قرابت ژنتیکی موجود بین 79 ژنوتیپ ن...

متن کامل

وضعیت تاکسونومیکی جنس pseudocerastes boulenger, 1896 (ophidia: viperidae) در ایران بر اساس صفات مولکولی و مورفولوژیک

جنس pseudocerastes boulenger, 1896 از خانواده¬ی viperidae و زیرخانواده¬ی viperinae یا افعی¬های دنیای قدیم است که در خاورمیانه از شرق کشور مصر در غرب تا کشورهای افغانستان و پاکستان در شرق پراکنش دارد. این جنس شامل سه گونه¬ی p. fieldi، p. persicus و p. urarachnoides است که دو گونه¬ی آن در کشور ایران یافت می-شود. اهداف متعددی که در این تحقیق دنبال می¬شوند عبارتند از: تعیین تعداد گونه¬های جنس pseud...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده زیست شناسی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023